home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00399 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.6 KB  |  62 lines
  1. *************************************
  2. * Fatty acid desaturases signatures *
  3. *************************************
  4.  
  5. Fatty acid desaturases (EC 1.14.99.-)  are enzymes that catalyze the insertion
  6. of a double bond at the delta position of fatty acids.
  7.  
  8. There seems to be two distinct families of fatty acid desaturases which do not
  9. seem to be evolutionary related.
  10.  
  11. Family 1 is composed of:
  12.  
  13.  - Stearoyl-CoA desaturase (SCD) (EC 1.14.99.5) [1].  SCD is  a key regulatory
  14.    enzyme of unsaturated fatty acid biosynthesis. SCD introduces a cis  double
  15.    bond at the delta(9) position of fatty acyl-CoA's such as palmitoleoyl- and
  16.    oleoyl-CoA. SCD is a membrane-bound enzyme that is thought to function as a
  17.    part of a multienzyme  complex in the  endoplasmic reticulum of vertebrates
  18.    and fungi.
  19.  
  20. As a signature pattern  for this family  we selected a conserved region in the
  21. C-terminal part of these enzymes,  this region  is rich  in histidine residues
  22. and in aromatic residues.
  23.  
  24. Family 2 is composed of:
  25.  
  26.  - Plants stearoyl-acyl-carrier-protein desaturase  (EC 1.14.99.6) [2],  these
  27.    enzymes catalyze the introduction of a double bond at the delta(9) position
  28.    of steraoyl-ACP to produce oleoyl-ACP.  This enzyme  is responsible for the
  29.    conversion of saturated  fatty  acids  to  unsaturated  fatty  acids in the
  30.    synthesis of vegetable oils.
  31.  - Cyanobacteria desA [3]  an  enzyme  that  can introduce a second cis double
  32.    bond  at  the  delta(12)   position  of  fatty   acid  bound  to  membranes
  33.    glycerolipids. DesA is involved in chilling tolerance; the phase transition
  34.    temperature of lipids of cellular membranes being dependent on  the  degree
  35.    of unsaturation of fatty acids of the membrane lipids.
  36.  
  37. As a signature pattern  for this family  we selected a conserved region in the
  38. C-terminal part of these enzymes.
  39.  
  40. -Consensus pattern: G-E-x-[FY]-H-N-[FY]-H-H-x-F-P-x-D-Y
  41. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL family 1
  42.  enzymes.
  43. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  44.  
  45. -Consensus pattern: [ST]-[SA]-x(3)-[QR]-[LI]-x(5,6)-D-Y-x(2)-[LIVMFYW]-[LIVM]-
  46.                     [DE]-x-L
  47. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL family 2
  48.  enzymes.
  49. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  50.  
  51. -Expert(s) to contact by email: Piffanelli P.
  52.                                 piffanelli@jii.afrc.ac.uk
  53.  
  54. -Last update: October 1993 / Patterns and text revised.
  55.  
  56. [ 1] Kaestner K.H., Ntambi J.M., Kelly T.J. Jr., Lane M.D.
  57.      J. Biol. Chem. 264:14755-14761(1989).
  58. [ 2] Shanklin J., Somerville C.R.
  59.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88:2510-2514(1991).
  60. [ 3] Wada H., Gombos Z., Murata N.
  61.      Nature 347:200-203(1990).
  62.